中心將建立跨領域綠技術實驗室資源整合，分為:

1. 『生物能機電生態系統應用與開發實驗群』：由CII執行長--國立宜蘭大學 王金燦 特聘教授主導。

1. 整合『生物能機電生態系統應用與開發實驗群』、『先進綠色材料開發實驗群』、『綠色生物化學催化技術實驗群』及開發技術。
2. 開發高降解性生物能應用與模擬分析系統。
3. 開發高性能微型生物能系統感測器。
4. 太空微重力場生物能源晶片效能分析

2. 『先進綠色材料開發實驗群』：由CII副執行長--國立台北科技大學 楊永欽 特聘教授主導。

1. 開發高抗蝕性極板材料。
2. 開發生物功能性極板材料。
3. 開發高電導性極板材料。

3. 『綠色生物化學催化技術實驗群』：由CII副執行長 國立台灣科技大學 王丞浩 教授主導。

1. 開發高催化性觸媒。
2. 開發長效性觸媒。
3. 開發MFC(微生物燃料電池)專用功能性觸媒。

長期目標：

透過跨領域整合涵蓋機械、環工、化工、材料、微/機電奈米系統、電子、奈米技術、生物技術等跨領域技術，結合不同領域研究人員特有之專長與技術，搭配個別實驗室現有設備與場地，發展為一個新興的特色研究領群。
為了更加與國際接軌合作，本中心也持續歡迎各個領域的專家學者加入，一同努力為中心付出一份心力。